a. Pusat informasi kegiatan pengendalian malaria di Kabupaten Halmahera Selatan
b. Pusat aktifitas dalam pengendalian malaria di Kabupaten Halmahera Selatan
c. Sekretariat Malaria Center Kabupaten Halmahera Selatan.
Dalam upaya mendukung fungsi Malaria Center maka Gedung Malaria Center terdiri atas ruang dan fasilitas sebagai berikut :
Lantai 1
a. Ruang KOPEM sebagai ruangan pimpinan dan staf.
b. Ruang Plasmodium sebagai ruangan Laboratorium. Berfungsi sebagai laboratorium cross check terhadap sediaan darah yang dikirimkan oleh puskesmas setiap bulannya.
c. Ruang Wallace sebagai ruangan Perpustakaan, baik buku-buku atau bahan bacaan yang berhubungan dengan malaria maupun lainnya
d. Ruang Artesunate sebagai ruangan Gudang/logistik
Ditambah dengan ruang untuk jamuan makan dan juga WC terpisah pria dan wanita sebanyak 4 kamar WC
Lantai 2
a. Ruang Gebrak Malaria sebagai ruangan tempat pelatihan/pertemuan yang dapat menampung 40 orang atau 1 (satu) kelas pelatihan.
b. Kamar-kamar tempat tidur sebanyak 10 kamar dengan kapasitas 30 orang. Kamar tidur masing-masing diberi nama dari spesies nyamuk anopheles yang ada di Halmahera Selatan
Ditambah dengan WC terpisah pria dan wanita sebanyak 6 kamar WC
